Der AJM ist demokratisch aufgebaut. Er ist föderalistisch strukturiert, da er mehrere lokale Mitgliedsgruppen hat, die als Verbindung zwischen seinen Mitgliedern und dem AJM fungieren.
Jedes Jahr haben die landesweiten Mitglieder (Ortsgruppen), die Möglichkeit zwei Delegierte zu entsenden, um das vorherige Jahr gemeinsam mit dem Vorstand Revue passieren zu lassen, neue Projekte und Maßnahmen für die Jahresagenda festzusetzen, sowie Arbeitsgruppen zu bilden. Zudem findet jedes zweite Jahr die AJM Vorstandswahl statt, um den neuen Vorstand des AJM demokratisch und auf Basis der Satzung zu wählen. Bei der Landesdelegiertenversammlung werden Beschlüsse gefasst oder verabschiedet, neue Ortsgruppen aufgenommen und der Haushaltsplan beschlossen.
Neben den zwei Vorsitzenden werden auch eine Schatzmeisterin und eine Schriftführerin gewählt, welche den geschäftsführenden Vorstand bilden. Daneben können noch bis zu vier Beisitzerinnen gewählt werden, welche Stimm- und Sprachrechte innehalten. Darüber hinaus werden auf jeder Landesdelegiertenversammlung zwei Revisorinnen gewählt, welche unabhängig vom Beirat die Kasse stichprobenartig prüfen.
In unseren Strukturen hat jede Ortsgruppe zwei Stimmen als Vertretungsrecht auf unserer Landesdelegiertenversammlung. Der Delegiertenschlüssel ist fest in unserer Satzung verankert.
Wir sind ein Mitgliedsverband der djo – Bayern (Deutsche Jugend in Europa). Die djo – Bayern tritt als unser Dachverband für unsere Belange, Interessen und Forderungen ein. Durch diese Mitgliedschaft sind wir beim Bayerischen Jugendring KdöR, den Stadt – und Kreisjugendringen vertreten.
